Le CI est l’organe législatif du Syndicat. Il est composé de 23 représentant-e-s de toutes les communes membres.
Il définit les orientations stratégiques générales et fonctionnelles de l’éorén, notamment en adoptant les règlements (principes unitaires, etc.) qui s’appliquent à l’ensemble du Syndicat. Il exerce la surveillance sur le Comité scolaire et les autres organes et est compétent pour toutes les questions financières (budget, comptes). Il élit les membres du Comité scolaire, ceux de la commission financière et choisit l’organe de révision.